RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 STAP2Q9UGK3 403 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 LAMB2P55268 1798 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 GREM2Q9H772 168 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 AOX1Q06278 1338 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 EYA2O00167 538 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 CIAO1O76071 339 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 ZNF827Q17R98 1081 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 AKT1S1Q96B36 256 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 FBXO3Q9UK99 471 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 ITGA6P23229 1130 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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PACS1-209ENST00000529757 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.42■□□□□ 0.86
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PACS1-209ENST00000529757 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 TFCP2Q12800 502 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.41■□□□□ 0.86
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PACS1-209ENST00000529757 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.4■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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PACS1-209ENST00000529757 LRRC24Q50LG9 513 aa20.39■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.39■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.39■□□□□ 0.86
PACS1-209ENST00000529757 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.39■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 RTL9Q8NET4 1388 aa20.39■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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PACS1-209ENST00000529757 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.38■□□□□ 0.85
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PACS1-209ENST00000529757 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 TNNI3KQ59H18 835 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.38■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 SDSP20132 328 aa20.37■□□□□ 0.85
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PACS1-209ENST00000529757 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 GPR108Q9NPR9 543 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.37■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 CDC45O75419 566 aa20.36■□□□□ 0.85
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PACS1-209ENST00000529757 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 LRP5O75197 1615 aa20.36■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 ERC2O15083 957 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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PACS1-209ENST00000529757 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 NPHP1O15259 732 aa20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 TM4SF1P30408 202 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 CNBD1Q8NA66 436 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.34■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 MSH5O43196 834 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 NLRP3Q96P20 1036 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 ZNF609O15014 1411 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.33■□□□□ 0.85
PACS1-209ENST00000529757 SEC24BO95487 1268 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 METTL24Q5JXM2 366 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 STK32BQ9NY57 414 aa20.31■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 CASZ1Q86V15 1759 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 SERPINB2P05120 415 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 SLC15A2Q16348 729 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 CASC1Q6TDU7 716 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 RILPL2Q969X0 211 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-209ENST00000529757 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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