RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516721.1

RNU6-965P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 965, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-965P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-965P-201ENST00000516721 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 HS2ST1Q7LGA3 356 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GALNT12Q8IXK2 581 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ARMC5Q96C12 935 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 HSH2DQ96JZ2 352 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 DRC1Q96MC2 740 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PNMA5Q96PV4 448 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 C12orf49Q9H741 205 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PSAPP07602 524 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CES1P23141 567 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CANXP27824 592 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 VPS37DQ86XT2 251 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC43A3Q8NBI5 491 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZFP42Q96MM3 310 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 RBSNQ9H1K0 784 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GGNBP2Q9H3C7 697 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 USP31Q70CQ4 1352 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 EFSO43281 561 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 VEGFBP49765 207 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PLAURQ03405 335 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 HYAL2Q12891 473 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ORC1Q13415 861 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SOGA3Q5TF21 947 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZNF654Q8IZM8 581 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZNF280CQ8ND82 737 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 OR13H1Q8NG92 308 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 UBXN4Q92575 508 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPACA7Q96KW9 195 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 CEP44Q9C0F1 390 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 MARK1Q9P0L2 795 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SLC35F4A4IF30 521 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 FAM177BA6PVY3 158 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GFRA3O60609 400 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 RHOQP17081 205 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 NRLP54845 237 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 FANCCQ00597 558 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 FAM26DQ5JW98 314 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIM46Q7Z4K8 759 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 RUBCNLQ9H714 662 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GPAMQ9HCL2 828 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 USP35Q9P2H5 1018 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SAMM50Q9Y512 469 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 FIGNL2A6NMB9 653 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 KIF4AO95239 1232 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 RARAP10276 462 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TNP2Q05952 138 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 NAALADL2Q58DX5 795 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SCARA3Q6AZY7 606 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SV2BQ7L1I2 683 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TRIM47Q96LD4 638 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 BCO2Q9BYV7 579 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GSX2Q9BZM3 304 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 EHD4Q9H223 541 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TMEM63CQ9P1W3 806 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 USP17L7P0C7H9 530 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 MAPTP10636 758 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 BMP1P13497 986 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 GPLD1P80108 840 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 PTSQ03393 145 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-965P-201ENST00000516721 SPEM2Q0P670 501 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms