RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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SH3BP2-228ENST00000515737 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-228ENST00000515737 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-228ENST00000515737 PARP10Q53GL7 1025 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-228ENST00000515737 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.58■□□□□ 0.88
SH3BP2-228ENST00000515737 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.58■□□□□ 0.88
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SH3BP2-228ENST00000515737 ATP2B3Q16720 1220 aa20.44■□□□□ 0.86
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