RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HACL1Q9UJ83 578 aa30.03■■■□□ 2.4
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF1P21675 1872 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NIM1KQ8IY84 436 aa30.02■■■□□ 2.4
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.99■■■□□ 2.39
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.98■■■□□ 2.39
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A2P04920 1241 aa29.95■■■□□ 2.39
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNRF3Q9ULT6 936 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.92■■■□□ 2.38
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCNN1DP51172 638 aa29.88■■■□□ 2.37
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C6orf229H3BNL8 230 aa29.87■■■□□ 2.37
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H7C1W4 665 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DOK7Q18PE1 504 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.77■■■□□ 2.36
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.77■■■□□ 2.36
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