RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 BBOX1O75936 387 aa31.82■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa31.82■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 F6X3S4 739 aa31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 TOMM70O94826 608 aa31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 IARSP41252 1262 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 GRAPQ13588 217 aa31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 TAF1P21675 1872 aa31.8■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 SSH1Q8WYL5 1049 aa31.8■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 BCL2L13Q9BXK5 485 aa31.79■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 SLC51AQ86UW1 340 aa31.78■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 LINS1Q8NG48 757 aa31.78■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 WDR90Q96KV7 1748 aa31.77■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 CDHR2Q9BYE9 1310 aa31.76■■■□□ 2.68
CXCL3-202ENST00000502974 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 GCKRQ14397 625 aa31.76■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 SP8Q8IXZ3 490 aa31.76■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 PDE8AO60658 829 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 ALDH1L2Q3SY69 923 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 TMC4Q7Z404 712 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 JDP2Q8WYK2 163 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa31.74■■■□□ 2.67
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CXCL3-202ENST00000502974 MYH3P11055 1940 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 DDNO94850 711 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 BEND3Q5T5X7 828 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 SLC4A10Q6U841 1118 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 H7C1W4 665 aa31.72■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 LARGE2Q8N3Y3 721 aa31.72■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 MPNDQ8N594 471 aa31.71■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 SUPT20HQ8NEM7 779 aa31.71■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 PTPRCP08575 1304 aa31.71■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC152Q4G0S7 254 aa31.7■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF541Q9H0D2 1346 aa31.7■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 COL4A1P02462 1669 aa31.7■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC37AA6NMS7 1700 aa31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 PPIP5K2O43314 1243 aa31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 HSPA6P17066 643 aa31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 FZD9O00144 591 aa31.68■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 CTSWP56202 376 aa31.68■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 NIM1KQ8IY84 436 aa31.67■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa31.67■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 VPS33BQ9H267 617 aa31.67■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 SEC31BQ9NQW1 1179 aa31.67■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 COL4A5P29400 1685 aa31.67■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 POTECB2RU33 542 aa31.66■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 CASP7P55210 303 aa31.66■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 EIF6P56537 245 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
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CXCL3-202ENST00000502974 IQCA1LA6NCM1 817 aa31.64■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 ALDH1L1O75891 902 aa31.64■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 RARSP54136 660 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
CXCL3-202ENST00000502974 SCN4AP35499 1836 aa31.63■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 TTLL11Q8NHH1 800 aa31.63■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 GPC2Q8N158 579 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 PLA2G12BQ9BX93 195 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 GRM8O00222 908 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 GREM2Q9H772 168 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
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CXCL3-202ENST00000502974 GJA3Q9Y6H8 435 aa31.6■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 SPEF2Q9C093 1822 aa31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA2012Q0VF49 1180 aa31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 GPSM2P81274 684 aa31.58■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
CXCL3-202ENST00000502974 RTL9Q8NET4 1388 aa31.57■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 HACL1Q9UJ83 578 aa31.57■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 ZNRF3Q9ULT6 936 aa31.57■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 C6orf229H3BNL8 230 aa31.56■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 APLP1P51693 650 aa31.56■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 KIF16BQ96L93 1317 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 FAM161AQ3B820 660 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 LTBP1Q14766 1721 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 CSF1RP07333 972 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 WASHC4Q2M389 1173 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 CEP350Q5VT06 3117 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 FOXO4P98177 505 aa31.53■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 EYA3Q99504 573 aa31.53■■■□□ 2.64
CXCL3-202ENST00000502974 ITGA6P23229 1130 aa31.52■■■□□ 2.64
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