RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.525e-13■□□□□ 9
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 SMC1BQ8NDV3 1235 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXW7Q969H0 707 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 DONSONQ9NYP3 566 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CASZ1Q86V15 1759 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF181Q9P0P0 153 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF652Q9Y2D9 606 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 BIRC2Q13490 618 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 BTAF1O14981 1849 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 FBLN1P23142 703 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TERF1P54274 439 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ST5P78524 1137 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR78Q5VTH9 848 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 SULT6B1Q6IMI4 303 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PANK3Q9H999 370 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ATG3Q9NT62 314 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 SBF2Q86WG5 1849 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 WNK3Q9BYP7 1800 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL33A6NCF5 533 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE6BP35913 854 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 AIDAQ96BJ3 306 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 POLKQ9UBT6 870 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-213ENST00000496055 TULP2O00295 520 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3BP5O60239 455 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 NFKBIBQ15653 356 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 LTN1O94822 1766 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0G2JLW4 131 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC189A1A4V9 331 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 RGL2O15211 777 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CREB3O43889 395 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 DPEP1P16444 411 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 RPAINQ86UA6 219 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 MAF1Q9H063 256 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SMAPO00193 183 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 PES1O00541 588 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 TNNT1P13805 278 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL6Q8N841 843 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CHD4Q14839 1912 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 USP54Q70EL1 1684 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CTAGE5O15320 804 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CRKLP46109 303 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CNKSR1Q969H4 720 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 VTI1AQ96AJ9 217 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 LMNB1P20700 586 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 LIG1P18858 919 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 CD151P48509 253 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 LRCH2Q5VUJ6 765 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 MORC4Q8TE76 937 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF39Q9H2S5 420 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SKILP12757 684 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 ITPK1Q13572 414 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SETDB2Q96T68 719 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 RGPD5Q99666 1765 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 TPM3P06753 285 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-213ENST00000496055 GYS1P13807 737 aa5.5□□□□□ -1.53
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