RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NIM1KQ8IY84 436 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KSR2Q6VAB6 950 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMC4Q7Z404 712 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPC2Q8N158 579 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VPS33BQ9H267 617 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HACL1Q9UJ83 578 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AOC3Q16853 763 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHADLQ6NUI6 762 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMB2P55268 1798 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POTEIP0CG38 1075 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POTEJP0CG39 1038 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 G2E3Q7L622 706 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EPHX2P34913 555 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL4A5P29400 1685 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LDHDQ86WU2 507 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDE8AO60658 829 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 VAMP4O75379 141 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGKV5-2P06315 115 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FLIIQ13045 1269 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KLRG1Q96E93 195 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TAF1P21675 1872 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCN4AP35499 1836 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C6orf229H3BNL8 230 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CXCL9Q07325 125 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPSM2P81274 684 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WASHC4Q2M389 1173 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EPS15P42566 896 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RIMBP2O15034 1052 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAD17O75943 681 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCNN1DP51172 638 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLLQ9UGP5 575 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNIP1Q15025 636 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EYA3Q99504 573 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CTSWP56202 376 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H7C1W4 665 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GCKRQ14397 625 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CNTROBQ8N137 903 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CREBZFQ9NS37 354 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPRC5DQ9NZD1 345 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PASKQ96RG2 1323 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL4A1P02462 1669 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 YDJCA8MPS7 323 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LINS1Q8NG48 757 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DOK7Q18PE1 504 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JMYQ8N9B5 988 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GGA1Q9UJY5 639 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 G3V3G9 751 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UFL1O94874 794 aa24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms