RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 SPEF2Q9C093 1822 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 HAUS7Q99871 368 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 KCNQ2O43526 872 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 GPTP24298 496 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 MCM2P49736 904 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 TICAM2Q86XR7 235 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 NHSQ6T4R5 1651 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 LRP5O75197 1615 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 MED23Q9ULK4 1368 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 LAMB2P55268 1798 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 CAMTA2O94983 1202 aa24.14■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 NEK4P51957 841 aa24.14■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 CTSWP56202 376 aa24.14■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 SYNE4Q8N205 404 aa24.14■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 AK7Q96M32 723 aa24.14■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 ARXQ96QS3 562 aa24.14■■□□□ 1.46
NELFE-211ENST00000492185 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 CERKQ8TCT0 537 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 FSD1Q9BTV5 496 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 BTAF1O14981 1849 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 PTH1RQ03431 593 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 FAM227BQ96M60 508 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 USP21Q9UK80 565 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 A0A0D9SFI3 127 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 PDE8AO60658 829 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 RASEFQ8IZ41 740 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 A0A1B0GUL7 405 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 CUL4AQ13619 759 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 NECTIN1Q15223 517 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 MAP4K1Q92918 833 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 A0A0G2JS52 829 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 MCM4P33991 863 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 TIMM10P62072 90 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 RGL2O15211 777 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 PARP10Q53GL7 1025 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 GREM2Q9H772 168 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 SBF2Q86WG5 1849 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.08■■□□□ 1.45
NELFE-211ENST00000492185 ITGA6P23229 1130 aa24.08■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 KBTBD3Q8NAB2 608 aa24.08■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TMX3Q96JJ7 454 aa24.08■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TTC14Q96N46 770 aa24.08■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.08■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 SCN7AQ01118 1682 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.07■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 SUSD4Q5VX71 490 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 LY75O60449 1722 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ABCC12Q96J65 1359 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ATRNO75882 1429 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ARAP2Q8WZ64 1704 aa24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 RTL9Q8NET4 1388 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.05■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.04■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TAF5LO75529 589 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 NTSR2O95665 410 aa24.03■■□□□ 1.44
NELFE-211ENST00000492185 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms