RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491859.5

USP19-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 3

Gene USP19, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-215ENST00000491859 LINS1Q8NG48 757 aa23.59■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.59■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 COL4A1P02462 1669 aa23.59■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 SPEF2Q9C093 1822 aa23.59■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.59■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 PDE8AO60658 829 aa23.58■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 BBOX1O75936 387 aa23.58■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.58■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.58■■□□□ 1.37
USP19-215ENST00000491859 GCKRQ14397 625 aa23.57■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.57■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.57■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 PSMD1Q99460 953 aa23.57■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.56■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.56■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 CTSWP56202 376 aa23.55■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.55■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.55■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 BEND3Q5T5X7 828 aa23.54■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 TMC4Q7Z404 712 aa23.54■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 SP8Q8IXZ3 490 aa23.54■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 GLTPD2A6NH11 291 aa23.53■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 H7C1W4 665 aa23.53■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.53■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 KIF3CO14782 793 aa23.52■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.52■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 PTPRCP08575 1304 aa23.52■■□□□ 1.36
USP19-215ENST00000491859 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.51■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 MPNDQ8N594 471 aa23.51■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 COL4A5P29400 1685 aa23.51■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 WDR90Q96KV7 1748 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 C1QTNF8P60827 252 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 JDP2Q8WYK2 163 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 RRAGCQ9HB90 399 aa23.5■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 PPIP5K2O43314 1243 aa23.49■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 CASP7P55210 303 aa23.49■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.49■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 LTBP1Q14766 1721 aa23.49■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 ALDH1L1O75891 902 aa23.48■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 AOC3Q16853 763 aa23.48■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 GREM2Q9H772 168 aa23.48■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.48■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 GRM8O00222 908 aa23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 NIM1KQ8IY84 436 aa23.46■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 RTL9Q8NET4 1388 aa23.46■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
USP19-215ENST00000491859 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.45■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 FAM161AQ3B820 660 aa23.45■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 FZD9O00144 591 aa23.44■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 GPSM2P81274 684 aa23.44■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 SCN4AP35499 1836 aa23.44■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 VPS33BQ9H267 617 aa23.43■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.43■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 C6orf229H3BNL8 230 aa23.42■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 TOMM70O94826 608 aa23.42■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 ITGA6P23229 1130 aa23.42■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.42■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.42■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 KIF16BQ96L93 1317 aa23.4■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 CSF1RP07333 972 aa23.4■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 FOXO4P98177 505 aa23.4■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 POLLQ9UGP5 575 aa23.4■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.4■■□□□ 1.34
USP19-215ENST00000491859 UFL1O94874 794 aa23.39■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 WASHC4Q2M389 1173 aa23.39■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.39■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 GGA1Q9UJY5 639 aa23.39■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 XDHP47989 1333 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 A0A1B0GUL6 1792 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 POTECB2RU33 542 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 RIMBP2O15034 1052 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 GPC2Q8N158 579 aa23.38■■□□□ 1.33
USP19-215ENST00000491859 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms