RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
HOXD10-202ENST00000490088 MASTLQ96GX5 879 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD10-202ENST00000490088 KAZALD1Q96I82 304 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXD10-202ENST00000490088 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 STYK1Q6J9G0 422 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 PIM2Q9P1W9 311 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 CSF1RP07333 972 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 GREM2Q9H772 168 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 MYH3P11055 1940 aa27.1■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 FAM161AQ3B820 660 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.09■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 GNAI2P04899 355 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 TTLL6Q8N841 843 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 CNKSR1Q969H4 720 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 CRBNQ96SW2 442 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.08■■□□□ 1.93
HOXD10-202ENST00000490088 ALDH1B1P30837 517 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 COL4A1P02462 1669 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 BCS1LQ9Y276 419 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 RTL9Q8NET4 1388 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 ITGA6P23229 1130 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 GRAPQ13588 217 aa27.05■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 TAF1P21675 1872 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 CACNA1SQ13698 1873 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 SLX4Q8IY92 1834 aa27.02■■□□□ 1.92
HOXD10-202ENST00000490088 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 SLC51AQ86UW1 340 aa27.01■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 C21orf2O43822 256 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 BBOX1O75936 387 aa26.99■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 OLFM4Q6UX06 510 aa26.98■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 MTX1Q13505 466 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 GPR162Q16538 588 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.97■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 SRGAP3O43295 1099 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 CEP85Q6P2H3 762 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
HOXD10-202ENST00000490088 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.95■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 ATP8B2P98198 1209 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 TMC4Q7Z404 712 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 SPEF2Q9C093 1822 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 SP8Q8IXZ3 490 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC93Q567U6 631 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 POLA2Q14181 598 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 SOGA3Q5TF21 947 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 SSH3Q8TE77 659 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.9■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 SIL1Q9H173 461 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXD10-202ENST00000490088 LRRC24Q50LG9 513 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms