RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489369.5

KANK1-209, Transcript of KN motif and ankyrin repeat domains 1, human

TSL 5

Gene KANK1, Length 7,193 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KANK1-209	ENST00000489369	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	ME1	P48163	572 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	PDC	P20941	246 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	ZBED4	O75132	1171 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KANK1-209	ENST00000489369	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	A1BG	P04217	495 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	GTF2I	P78347	998 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	TTC6	Q86TZ1	520 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	EYA1	Q99502	592 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.21	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CHST3	Q7LGC8	479 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	BIRC2	Q13490	618 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	NSD2	O96028	1365 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	GRM8	O00222	908 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	TSG101	Q99816	390 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ITGA6	P23229	1130 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ANAPC15	P60006	121 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PDE8A	O60658	829 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	MX1	P20591	662 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SIK1	P57059	783 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	AAMP	Q13685	434 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PHACTR2	O75167	634 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SMC2	O95347	1197 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SERPINB2	P05120	415 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.18	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PTPRC	P08575	1304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	NUP160	Q12769	1436 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	OSBP	P22059	807 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	RAD17	O75943	681 aa		11.17	□□□□□ -0.62
KANK1-209	ENST00000489369	JCAD	Q9P266	1359 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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