RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.45□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 A6NHS1 94 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 BMP4P12644 408 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 CTBSQ01459 385 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 GIPC2Q8TF65 315 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 IGF1RP08069 1367 aa8.44□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS2O95450 1211 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 SLURP2P0DP57 97 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ELP3Q9H9T3 547 aa8.43□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF21O75509 655 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 CD33P20138 364 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 MAPK8P45983 427 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 FGD1P98174 961 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 CCINQ13939 588 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 NLRP13Q86W25 1043 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 EFCC1Q9HA90 598 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 STRN4Q9NRL3 753 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 C2CD2LO14523 706 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ZNF428Q96B54 188 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 GSX2Q9BZM3 304 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 HCN2Q9UL51 889 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ATP2B2Q01814 1243 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 SPEM2Q0P670 501 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 ORC1Q13415 861 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 PNMA5Q96PV4 448 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 CSRNP1Q96S65 589 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL20-204ENST00000489160 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 PHACTR2O75167 634 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ARAFP10398 606 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 NEUROD1Q13562 356 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 BCL11AQ9H165 835 aa8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 SASH3O75995 380 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 SLC30A3Q99726 388 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 STK17AQ9UEE5 414 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 RARAP10276 462 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 GRIN2CQ14957 1233 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 FBF1Q8TES7 1133 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 PMEPA1Q969W9 287 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K6O95382 1288 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 NFKB1P19838 968 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ACDQ96AP0 544 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 UNCXA6NJT0 531 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 E9PSI1 815 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 SIN3BO75182 1162 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 BCRP11274 1271 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ADH6P28332 368 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K10Q02779 954 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 BHMTQ93088 406 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 CHRDQ9H2X0 955 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 CNTN3Q9P232 1028 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ZFATQ9P243 1243 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 MMP20O60882 483 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 CES1P23141 567 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 SYT9Q86SS6 491 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 SVOPQ8N4V2 548 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 OR13H1Q8NG92 308 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CCL20-204ENST00000489160 GGA1Q9UJY5 639 aa8.34□□□□□ -1.07
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