RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488229.1

RPSAP4-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP4, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP4-201ENST00000488229 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CCER2I3L3R5 266 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 BBOX1O75936 387 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 POTEIP0CG38 1075 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 POTEJP0CG39 1038 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 HSPA6P17066 643 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 STK31Q9BXU1 1019 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CACNA1FO60840 1977 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 H7C1W4 665 aa14.68□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.67□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 F6X3S4 739 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 SLFN5Q08AF3 891 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 AOC3Q16853 763 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.66□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 PDE8AO60658 829 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 GPSM2P81274 684 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 GCKRQ14397 625 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 MIER1Q8N108 512 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 POLLQ9UGP5 575 aa14.65□□□□□ -0.06
RPSAP4-201ENST00000488229 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 HTRA3P83110 453 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 FSTL1Q12841 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 BEND3Q5T5X7 828 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 MPNDQ8N594 471 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SCN4AP35499 1836 aa14.64□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 YDJCA8MPS7 323 aa14.63□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 PPIP5K2O43314 1243 aa14.63□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.63□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.63□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SCNN1DP51172 638 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 CTSWP56202 376 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 CXCL9Q07325 125 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 GPC2Q8N158 579 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 LINS1Q8NG48 757 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 VPS33BQ9H267 617 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 GREM2Q9H772 168 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 MYH3P11055 1940 aa14.62□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 E9PSI1 815 aa14.61□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.61□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 TMC4Q7Z404 712 aa14.61□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.61□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 RTL9Q8NET4 1388 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 CSF1RP07333 972 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 EPS15P42566 896 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 FOXO4P98177 505 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 JDP2Q8WYK2 163 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SPEF2Q9C093 1822 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 NIM1KQ8IY84 436 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 KAZALD1Q96I82 304 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SCN9AQ15858 1988 aa14.58□□□□□ -0.07
RPSAP4-201ENST00000488229 SHTN1A0MZ66 631 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 EPHX2P34913 555 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 APLP1P51693 650 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 HACL1Q9UJ83 578 aa14.58□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 RIMBP2O15034 1052 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 RAD17O75943 681 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 FAM161AQ3B820 660 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 CHADLQ6NUI6 762 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.57□□□□□ -0.08
RPSAP4-201ENST00000488229 PASKQ96RG2 1323 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms