RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-210	ENST00000469034	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	ALX3	O95076	343 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	CD97	P48960	835 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	SIX5	Q8N196	739 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TTC9	Q92623	222 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	BCS1L	Q9Y276	419 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	DLL1	O00548	723 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	RTN1	Q16799	776 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	GPLD1	P80108	840 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	ATP9B	O43861	1147 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	DKK1	O94907	266 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	RARA	P10276	462 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	IFT43	Q96FT9	208 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	SASH3	O75995	380 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	INPP5B	P32019	993 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	IDH3A	P50213	366 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
SUMO1-210	ENST00000469034	MED26	O95402	600 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	GSC2	O15499	205 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	RASA1	P20936	1047 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	SEC13	P55735	322 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	POM121	Q96HA1	1249 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	TGFB1	P01137	390 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	GLB1	P16278	677 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	ARSD	P51689	593 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	NRL	P54845	237 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	HINFP	Q9BQA5	517 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	RNF114	Q9Y508	228 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	LGR5	O75473	907 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	DGKZ	Q13574	1117 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034		Q6ZS46	218 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034		J3QW42	95 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	RAD21	O60216	631 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	MICAL2	O94851	1124 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	GHRH	P01286	108 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	IGFBP4	P22692	258 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	SIK1	P57059	783 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	SCRIB	Q14160	1630 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SUMO1-210	ENST00000469034	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	USP20	Q9Y2K6	914 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	ADAMTS4	O75173	837 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	PSAP	P07602	524 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	GRIK1	P39086	918 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	FZD5	Q13467	585 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	EGFR	P00533	1210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	NFIA	Q12857	509 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SUMO1-210	ENST00000469034	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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