RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 COL26A1Q96A83 441 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ADAM23O75077 832 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 RARAP10276 462 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 SASH3O75995 380 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 APBA3O96018 575 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CPB1P15086 417 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM35AQ86V20 835 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 XYLBO75191 536 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 EGFRP00533 1210 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 FURINP09958 794 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 NACC1Q96RE7 527 aa8.59□□□□□ -1.03
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 GPLD1P80108 840 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFRSF10BO14763 440 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 GATA4P43694 442 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 SLAIN2Q9P270 581 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIK4Q16099 956 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM26DQ5JW98 314 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0A0MRY4 1105 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 NRLP54845 237 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 PERM1Q5SV97 790 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP2B4P23634 1241 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 RAC1P63000 192 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 DOC2BQ14184 412 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 ELNP15502 786 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 MMP20O60882 483 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 PSAPP07602 524 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 ZAP70P43403 619 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 PLAURQ03405 335 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIK5Q16478 980 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 MSL1Q68DK7 614 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGGTB-204ENST00000461653 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 STIM2Q9P246 746 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf172C9J069 976 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ILDR2Q71H61 639 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 NLRP13Q86W25 1043 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ABTB2Q8N961 1025 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC9Q92623 222 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SEPT3Q9UH03 358 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SELPP16109 830 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SOX18P35713 384 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 J3QW42 95 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SIK1P57059 783 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB39O15060 712 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 GHRHP01286 108 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR152Q8TDT2 470 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PLD4Q96BZ4 506 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRE1Q14246 886 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 C14orf37Q86TY3 774 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 MBTPS1Q14703 1052 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 RBSNQ9H1K0 784 aa8.48□□□□□ -1.05
RABGGTB-204ENST00000461653 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.48□□□□□ -1.05
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