RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNFRSF10BO14763 440 aa12.03□□□□□ -0.48
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LDHBP07195 334 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYT1Q01538 1121 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPNDQ8N594 471 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABTB2Q8N961 1025 aa12.03□□□□□ -0.48
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM129BQ96TA1 746 aa12.03□□□□□ -0.48
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.03□□□□□ -0.48
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.03□□□□□ -0.48
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 EHHADHQ08426 723 aa12.02□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLIT1O75093 1534 aa12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAPK8P45983 427 aa12.01□□□□□ -0.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPIAP49247 311 aa12.01□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRS2Q9HD23 443 aa12□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 EID1Q9Y6B2 187 aa12□□□□□ -0.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.99□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFYVE9O95405 1425 aa11.99□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.98□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK2AP1O14519 115 aa11.97□□□□□ -0.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR182O15218 404 aa11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 NR5A1Q13285 461 aa11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.97□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED14O60244 1454 aa11.96□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAB2P98082 770 aa11.96□□□□□ -0.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.96□□□□□ -0.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.95□□□□□ -0.5
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNC4Q03721 635 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMD2Q13200 908 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM161BQ96MY7 647 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.94□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZBTB39O15060 712 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL2RAP01589 272 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLR1Q15399 786 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALG1LQ6GMV1 187 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GJD3Q8N144 294 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERTM1A2A2V5 107 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIAH2O43255 324 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
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