RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.6□□□□□ -1.19
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USP46-201ENST00000441222 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa7.6□□□□□ -1.19
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USP46-201ENST00000441222 A6NNZ2 444 aa7.6□□□□□ -1.19
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USP46-201ENST00000441222 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.59□□□□□ -1.19
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USP46-201ENST00000441222 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.59□□□□□ -1.19
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USP46-201ENST00000441222 CFAP58Q5T655 872 aa7.59□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.58□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 EBAG9O00559 213 aa7.58□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 KIF3CO14782 793 aa7.58□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 WTAPQ15007 396 aa7.58□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.58□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CCDC63Q8NA47 563 aa7.58□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 ESR2Q92731 530 aa7.58□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.58□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 C6orf229H3BNL8 230 aa7.57□□□□□ -1.2
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USP46-201ENST00000441222 VAV2P52735 878 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 SETDB1Q15047 1291 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 LIG1P18858 919 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 BMP2KLQ5H9B9 411 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 IFT74Q96LB3 600 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 IGF1RP08069 1367 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 KIF14Q15058 1648 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CALM1P0DP23 149 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CALM2P0DP24 149 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 CALM3P0DP25 149 aa7.57□□□□□ -1.2
USP46-201ENST00000441222 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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