RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SP8	Q8IXZ3	490 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KIF3C	O14782	793 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CASP7	P55210	303 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PSMD1	Q99460	953 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LAMB2	P55268	1798 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RRAGC	Q9HB90	399 aa		31.28	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GLTPD2	A6NH11	291 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL4A1	P02462	1669 aa		31.26	■■■□□ 2.6
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.25	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CTSW	P56202	376 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MPND	Q8N594	471 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TAF1	P21675	1872 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C1QTNF8	P60827	252 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GREM2	Q9H772	168 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TMC4	Q7Z404	712 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		31.2	■■■□□ 2.59
ARL6IP4-208	ENST00000439686	POTEC	B2RU33	542 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GPSM2	P81274	684 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ALDH1L1	O75891	902 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AOC3	Q16853	763 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PTPRC	P08575	1304 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FZD9	O00144	591 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PPIP5K2	O43314	1243 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CSF1R	P07333	972 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL4A5	P29400	1685 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GRM8	O00222	908 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FOXO4	P98177	505 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	JDP2	Q8WYK2	163 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.15	■■■□□ 2.58
ARL6IP4-208	ENST00000439686	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.13	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		31.12	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ITGA6	P23229	1130 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NIM1K	Q8IY84	436 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	VPS33B	Q9H267	617 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KAZALD1	Q96I82	304 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TOMM70	O94826	608 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SUCLG2	Q96I99	432 aa		31.09	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BCAR3	O75815	825 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.07	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USP44	Q9H0E7	712 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.06	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UTY	O14607	1347 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UFL1	O94874	794 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CXCL9	Q07325	125 aa		31.04	■■■□□ 2.56

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