RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGAT1O75907 488 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 PKDCCQ504Y2 493 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 NWD1Q149M9 1564 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED14O60244 1454 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.73□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXO3O43524 673 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMP1P13497 986 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPC1P35052 558 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPLO60437 1756 aa6.72□□□□□ -1.33
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 UPP2O95045 317 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMP2P12643 396 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINB4P48594 390 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEPT3Q9UH03 358 aa6.71□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROCK1Q13464 1354 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFT172Q9UG01 1749 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOS1P29475 1434 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 AXIN1O15169 862 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEAQ6S8J7 498 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRPM2O94759 1503 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NALCNQ8IZF0 1738 aa6.7□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTECB2RU33 542 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOS2P35228 1153 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.69□□□□□ -1.34
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RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF217Q8TC41 542 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL26A1Q96A83 441 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 CABP1Q9NZU7 370 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIP2AQ14689 1571 aa6.69□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ST8SIA5O15466 376 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEAD4Q15561 434 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NBPF15Q8N660 670 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP42Q96MM3 310 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 AAASQ9NRG9 546 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 DACH1Q9UI36 760 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.68□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFYVE9O95405 1425 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERTM1A2A2V5 107 aa6.67□□□□□ -1.34
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RPS3AP54-201ENST00000435535 SCARF1Q14162 830 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4orf17Q53FE4 359 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTMR7Q9Y216 660 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP155O75694 1391 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAIPQ13075 1403 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.67□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTLL8A6PVC2 850 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABL1P00519 1130 aa6.66□□□□□ -1.34
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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