RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434561.1

TP53BP1-208, Transcript of tumor protein p53 binding protein 1, human

TSL 3

Gene TP53BP1, Length 613 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP1-208	ENST00000434561	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	SCNN1D	P51172	638 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	COPS6	Q7L5N1	327 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPC2	Q8N158	579 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		12.04	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	CACNA1F	O60840	1977 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	SCN9A	Q15858	1988 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	NIM1K	Q8IY84	436 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	ABCC4	O15439	1325 aa		12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
TP53BP1-208	ENST00000434561	LBX1	P52954	281 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	SHTN1	A0MZ66	631 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	NLRP10	Q86W26	655 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	MYH3	P11055	1940 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	RAD17	O75943	681 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CXCL9	Q07325	125 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	PARP10	Q53GL7	1025 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	DLK2	Q6UY11	383 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	AIDA	Q96BJ3	306 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	TSKS	Q9UJT2	592 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ERBB4	Q15303	1308 aa		12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	MPND	Q8N594	471 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	AOC2	O75106	756 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	VAMP4	O75379	141 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CST9	Q5W186	159 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	PSME4	Q14997	1843 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TP53BP1-208	ENST00000434561	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	GRAP	Q13588	217 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	BBOX1	O75936	387 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TP53BP1-208	ENST00000434561	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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