RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	23.01	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	NIM1K	Q8IY84	436 aa		23.01	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS33B	Q9H267	617 aa		23.01	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	HYPK	Q9NX55	129 aa		23.01	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		23	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD8	Q96I13	439 aa		23	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPNS2	Q96L46	248 aa		23	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	23	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	PPIP5K2	O43314	1243 aa		22.99	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC27	Q2M243	656 aa		22.99	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	CST9	Q5W186	159 aa		22.99	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC51A	Q86UW1	340 aa		22.99	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		22.99	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	22.98	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	22.98	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		22.98	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		22.98	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	22.98	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		22.98	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		22.97	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF5	O00463	557 aa		22.97	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	22.97	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	22.97	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCC4	O15439	1325 aa		22.97	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	AOC3	Q16853	763 aa		22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		22.96	■■□□□ 1.27
MRPL28-203	ENST00000429738	ANP32C	O43423	234 aa		22.95	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	22.95	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCL9	Q07325	125 aa		22.95	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		22.95	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	22.94	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	GRM1	Q13255	1194 aa		22.94	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	22.94	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	22.94	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	MRS2	Q9HD23	443 aa		22.94	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF1	P21675	1872 aa		22.94	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	BBOX1	O75936	387 aa		22.93	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP2K2	P36507	400 aa		22.93	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	WWC1	Q8IX03	1113 aa		22.93	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		22.92	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	SP8	Q8IXZ3	490 aa		22.92	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		22.91	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	TSPYL6	Q8N831	410 aa		22.91	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		22.91	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	GOLGA2	Q08379	1002 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	MPND	Q8N594	471 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM89A	Q96GI7	184 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		22.9	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	IL16	Q14005	1332 aa		22.89	■■□□□ 1.26
MRPL28-203	ENST00000429738	AOC2	O75106	756 aa		22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GRAP	Q13588	217 aa		22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF428	Q96B54	188 aa		22.89	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		22.88	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TNIP1	Q15025	636 aa		22.88	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	22.88	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	22.88	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		22.88	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	22.88	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		22.87	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		22.87	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM161A	Q3B820	660 aa		22.87	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		22.87	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CA12	O43570	354 aa		22.86	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD17	O75943	681 aa		22.86	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	22.86	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TSKS	Q9UJT2	592 aa		22.86	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TMC4	Q7Z404	712 aa		22.85	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	22.85	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	COL4A1	P02462	1669 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS19	P49795	217 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MYD88	Q99836	296 aa		22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	22.84	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	22.83	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	22.83	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	22.83	■■□□□ 1.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNA1F	O60840	1977 aa		22.83	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738		H7C1D1	291 aa		22.82	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	22.82	■■□□□ 1.24

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