RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 GPTP24298 496 aa23.08■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 ANAPC15P60006 121 aa23.08■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.08■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 SGSM2O43147 1006 aa23.07■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 CTSWP56202 376 aa23.07■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.07■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.06■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.06■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.05■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.04■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.04■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.04■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 LAMB2P55268 1798 aa23.04■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.03■■□□□ 1.28
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HDAC10-204ENST00000429374 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 SNRKQ9NRH2 765 aa23.03■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.03■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 RAD50Q92878 1312 aa23.03■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF609O15014 1411 aa23.03■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.02■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 LRRC24Q50LG9 513 aa23.02■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.02■■□□□ 1.28
HDAC10-204ENST00000429374 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 SUSD4Q5VX71 490 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 HAUS7Q99871 368 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 RTL9Q8NET4 1388 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 SPEF2Q9C093 1822 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 SCN7AQ01118 1682 aa23.01■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 ITGA6P23229 1130 aa23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 BOLA2Q9H3K6 86 aa23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 SYNE4Q8N205 404 aa23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 NTSR2O95665 410 aa22.99■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.99■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
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HDAC10-204ENST00000429374 HSPA4P34932 840 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 GREM2Q9H772 168 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 NARFQ9UHQ1 456 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 ABCC12Q96J65 1359 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 LRP5O75197 1615 aa22.98■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 A0A1B0GUL7 405 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 ST18O60284 1047 aa22.97■■□□□ 1.27
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HDAC10-204ENST00000429374 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.97■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 FSD1Q9BTV5 496 aa22.96■■□□□ 1.27
HDAC10-204ENST00000429374 MCM2P49736 904 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 TIMM10P62072 90 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 IL25Q9H293 177 aa22.95■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.94■■□□□ 1.26
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HDAC10-204ENST00000429374 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 C4BP0C0L5 1744 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 KCNB2Q92953 911 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.93■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 METTL24Q5JXM2 366 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 FAM182BQ5T319 152 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 NYXQ9GZU5 481 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.92■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.91■■□□□ 1.26
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HDAC10-204ENST00000429374 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.91■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 MED23Q9ULK4 1368 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 PDE8BO95263 885 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 ADRA2BP18089 450 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 DDIT3P35638 169 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 XAGE2Q96GT9 111 aa22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HDAC10-204ENST00000429374 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.9■■□□□ 1.26
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