RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MASTLQ96GX5 879 aa10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUCLG2Q96I99 432 aa10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COG6Q9Y2V7 657 aa10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EPHA10Q5JZY3 1008 aa10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLHL34Q8N239 644 aa10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNKSR1Q969H4 720 aa10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRAMP1Q96RY5 1269 aa10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNAI2P04899 355 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MTX1Q13505 466 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIM2Q9P1W9 311 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ALDH1B1P30837 517 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRAPQ13588 217 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM161AQ3B820 660 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GREM2Q9H772 168 aa10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BBOX1O75936 387 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AAMPQ13685 434 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMC4Q7Z404 712 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTLL6Q8N841 843 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LAMB2P55268 1798 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITGA6P23229 1130 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS8P62241 208 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRBNQ96SW2 442 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.21□□□□□ -0.77
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.21□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP85Q6P2H3 762 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa10.2□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNED1Q8TER0 1413 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRGAP3O43295 1099 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP8B2P98198 1209 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLA2Q14181 598 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOGA3Q5TF21 947 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SP8Q8IXZ3 490 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.19□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SSH3Q8TE77 659 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RNF39Q9H2S5 420 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COPRSQ9NQ92 184 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO3Q9UK99 471 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BCS1LQ9Y276 419 aa10.18□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C21orf2O43822 256 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CIAO1O76071 339 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC93Q567U6 631 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL4A1P02462 1669 aa10.17□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.16□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa10.16□□□□□ -0.78
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms