RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLRP10Q86W26 655 aa24.03■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 SP8Q8IXZ3 490 aa24.03■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.03■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 AOC2O75106 756 aa24.02■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 RAD17O75943 681 aa24.02■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.02■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.02■■□□□ 1.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TNIP1Q15025 636 aa24.01■■□□□ 1.43
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TSKSQ9UJT2 592 aa24.01■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP2K2P36507 400 aa24■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRAPQ13588 217 aa24■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 SAPCD2Q86UD0 394 aa24■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF408Q9H9D4 720 aa24■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24■■□□□ 1.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDHR2Q9BYE9 1310 aa24■■□□□ 1.43
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.97■■□□□ 1.43
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.97■■□□□ 1.43
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.97■■□□□ 1.43
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UPK3BP1-201ENST00000428678 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.95■■□□□ 1.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 SHTN1A0MZ66 631 aa23.94■■□□□ 1.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 H7C1D1 291 aa23.94■■□□□ 1.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 CA12O43570 354 aa23.94■■□□□ 1.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 KRT24Q2M2I5 525 aa23.94■■□□□ 1.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.93■■□□□ 1.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 NEUROD2Q15784 382 aa23.93■■□□□ 1.42
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.93■■□□□ 1.42
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UPK3BP1-201ENST00000428678 C6orf229H3BNL8 230 aa23.88■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.88■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.87■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOGQ13253 232 aa23.87■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.87■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFAP44Q96MT7 982 aa23.87■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.87■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GPSM2P81274 684 aa23.86■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.86■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.86■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZIC5Q96T25 663 aa23.85■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ECE2O60344 883 aa23.84■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 EGFRP00533 1210 aa23.84■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 DOK7Q18PE1 504 aa23.84■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.84■■□□□ 1.41
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UPK3BP1-201ENST00000428678 HOXB7P09629 217 aa23.83■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGS19P49795 217 aa23.83■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 DGKZQ13574 1117 aa23.83■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.83■■□□□ 1.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADM5C9JUS6 153 aa23.82■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 RUNDC1Q96C34 613 aa23.82■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
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