RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 RASEFQ8IZ41 740 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 SNX14Q9Y5W7 946 aa28.04■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 HIP1O00291 1037 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 CSF1RP07333 972 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.03■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 CIAO1O76071 339 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 IL17RAQ96F46 866 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 MCM4P33991 863 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.02■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 CHGBP05060 677 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 GREM2Q9H772 168 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1B0GUL7 405 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 FAM177BA6PVY3 158 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 KCNQ4P56696 695 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 USP21Q9UK80 565 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 PTF1AQ7RTS3 328 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL11Q8NHH1 800 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 TMX3Q96JJ7 454 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS7Q99871 368 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 GPR108Q9NPR9 543 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 CEP126Q9P2H0 1117 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC171Q6TFL3 1326 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF609O15014 1411 aa28■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 CTSWP56202 376 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.99■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 ITGA6P23229 1130 aa27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 SSFA2P28290 1259 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 FAM182BQ5T319 152 aa27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 GOLIM4O00461 696 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 CPA1P15085 419 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ4P48050 445 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 MCM2P49736 904 aa27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
FAAP20-209ENST00000428120 CAMTA2O94983 1202 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 ADORA1P30542 326 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 PKP1Q13835 747 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SUSD4Q5VX71 490 aa27.95■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 MED23Q9ULK4 1368 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 GSE1Q14687 1217 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.94■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 PDE8AO60658 829 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 MAP4K1Q92918 833 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SNRKQ9NRH2 765 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 MYH3P11055 1940 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 NECTIN1Q15223 517 aa27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO3Q9UK99 471 aa27.92■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 METTL24Q5JXM2 366 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 GORABQ5T7V8 394 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 XAGE2Q96GT9 111 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 RREB1Q92766 1687 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SMIM5Q71RC9 77 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 TTC14Q96N46 770 aa27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 CERKQ8TCT0 537 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.89■■■□□ 2.06
FAAP20-209ENST00000428120 AK2P54819 239 aa27.89■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 TAF5LO75529 589 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 GBP4Q96PP9 640 aa27.88■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA1LP34931 641 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 KCNB2Q92953 911 aa27.87■■■□□ 2.05
FAAP20-209ENST00000428120 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 196.5 ms