RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECE1P42892 770 aa17.24■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPNDQ8N594 471 aa17.24■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPNS2Q96L46 248 aa17.24■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3TC1Q8TE82 1336 aa17.24■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDHR2Q9BYE9 1310 aa17.24■□□□□ 0.35
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA2012Q0VF49 1180 aa17.24■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCIRG1Q13488 830 aa17.24■□□□□ 0.35
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST9Q5W186 159 aa17.24■□□□□ 0.35
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC146Q8IYE0 955 aa17.21■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHPF2Q9P2E5 772 aa17.21■□□□□ 0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHL1O00533 1208 aa17.2■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD17O75943 681 aa17.2■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMC4Q7Z404 712 aa17.2■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL2L13Q9BXK5 485 aa17.2■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNIP1Q15025 636 aa17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEGAINQ9BUH8 593 aa17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17.19■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXB7P09629 217 aa17.18■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.18■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLBD2Q8NHP8 589 aa17.18■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.18■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.18■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF428Q96B54 188 aa17.18■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABHD8Q96I13 439 aa17.18■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL4A1P02462 1669 aa17.17■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa17.16■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HHIPL1Q96JK4 782 aa17.16■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHTN1A0MZ66 631 aa17.15■□□□□ 0.34
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC37L1Q7L3B6 337 aa17.15■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MICALL2Q8IY33 904 aa17.15■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF408Q9H9D4 720 aa17.15■□□□□ 0.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa17.14■□□□□ 0.33
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASHC4Q2M389 1173 aa17.14■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.14■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD14O00487 310 aa17.13■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HYPKQ9NX55 129 aa17.13■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSKSQ9UJT2 592 aa17.13■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA12O43570 354 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPF2Q92785 391 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP44Q96MT7 982 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf229H3BNL8 230 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIMBP2O15034 1052 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPSM2P81274 684 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP27Q5VZP5 1158 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLLQ9UGP5 575 aa17.12■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ECE2O60344 883 aa17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD7Q7Z3H4 446 aa17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP48Q86UV5 1035 aa17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EYA3Q99504 573 aa17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBIPQ9NS73 344 aa17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.11■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTL9Q8NET4 1388 aa17.1■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN9AQ15858 1988 aa17.1■□□□□ 0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS12P25398 132 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
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