RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.24■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 EID1Q9Y6B2 187 aa22.23■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 RNF20Q5VTR2 975 aa22.23■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TNNT1P13805 278 aa22.22■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.22■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 GRM8O00222 908 aa22.21■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.21■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 IP6K1Q92551 441 aa22.21■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 BRF1Q92994 677 aa22.21■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 TBX22Q9Y458 520 aa22.21■■□□□ 1.15
NEFHP1-201ENST00000412845 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 RESTQ13127 1097 aa22.2■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 COL15A1P39059 1388 aa22.2■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 SMTNL1A8MU46 457 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 TAF5LO75529 589 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 CHGBP05060 677 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ARID5BQ14865 1188 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 USP54Q70EL1 1684 aa22.19■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 IGSF3O75054 1194 aa22.18■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 GTF3C6Q969F1 213 aa22.18■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.18■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 JCADQ9P266 1359 aa22.18■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 LINS1Q8NG48 757 aa22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 PXDNQ92626 1479 aa22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 A0A087WWV3 80 aa22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 IQCB1Q15051 598 aa22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNA6P17658 529 aa22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 USP27XA6NNY8 438 aa22.15■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.15■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 UTYO14607 1347 aa22.15■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 FOSBP53539 338 aa22.15■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 Q6ZUG5 572 aa22.15■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.15■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 IGKV5-2P06315 115 aa22.14■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.14■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF592Q92610 1267 aa22.14■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 NEK1Q96PY6 1258 aa22.14■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.14■■□□□ 1.14
NEFHP1-201ENST00000412845 H3BQV1 296 aa22.14■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.14■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 IFFO2Q5TF58 517 aa22.14■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.14■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.13■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 SLIT1O75093 1534 aa22.13■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.13■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 CDC25BP30305 580 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 SYCP1Q15431 976 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 FEZ1Q99689 392 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 NFAT5O94916 1531 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 SCRN1Q12765 414 aa22.12■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.11■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP135Q66GS9 1140 aa22.11■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 CYP21A2P08686 494 aa22.11■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 PDIA6Q15084 440 aa22.11■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 OGFRQ9NZT2 677 aa22.11■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 USP16Q9Y5T5 823 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 KRT32Q14532 448 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 SARM1Q6SZW1 724 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 CFAP45Q9UL16 551 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF609O15014 1411 aa22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.09■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 PPFIA3O75145 1194 aa22.09■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEFHP1-201ENST00000412845 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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