RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PHF14O94880 888 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-205ENST00000409985 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PMS1-205ENST00000409985 PTH1RQ03431 593 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-205ENST00000409985 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PMS1-205ENST00000409985 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-205ENST00000409985 PDLIM2Q96JY6 352 aa28.52■■■□□ 2.16
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 RBSNQ9H1K0 784 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ITGB4P16144 1822 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 TICAM2Q86XR7 235 aa28.51■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 PSMA5P28066 241 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.5■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 KCNQ2O43526 872 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 MYD88Q99836 296 aa28.49■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 STX6O43752 255 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 RNF20Q5VTR2 975 aa28.48■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 MED23Q9ULK4 1368 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 SBF2Q86WG5 1849 aa28.47■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 MYL6BP14649 208 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ATP5JP18859 108 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 BCL9O00512 1426 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ZSCAN30Q86W11 494 aa28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 SYT1P21579 422 aa28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD1Q15327 319 aa28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 USP16Q9Y5T5 823 aa28.45■■■□□ 2.15
PMS1-205ENST00000409985 CABP4P57796 275 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 USP48Q86UV5 1035 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 PIGBQ92521 554 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 SYCE3A1L190 88 aa28.44■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 F13A1P00488 732 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.43■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 CHAMP1Q96JM3 812 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 FSD1Q9BTV5 496 aa28.42■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 SLC27A2O14975 620 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 FAM227BQ96M60 508 aa28.41■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 CASP7P55210 303 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 UBE2HP62256 183 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 TSPY26PQ9H489 355 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ4P48050 445 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 TNNI3KQ59H18 835 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.4■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 NHSQ6T4R5 1651 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 KRT32Q14532 448 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 SIL1Q9H173 461 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.39■■■□□ 2.14
PMS1-205ENST00000409985 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 PAPPAQ13219 1627 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 GJB2P29033 226 aa28.38■■■□□ 2.13
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PMS1-205ENST00000409985 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.38■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 A0A0D9SFI3 127 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 MCM5P33992 734 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 CCDC183Q5T5S1 534 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 GPR108Q9NPR9 543 aa28.37■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 H7C1W4 665 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 LARGE1O95461 756 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 PDCP20941 246 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 MTMR6Q9Y217 621 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.36■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WZG4 1122 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 CPA1P15085 419 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 ME3Q16798 604 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.35■■■□□ 2.13
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