RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
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PTPRN-202ENST00000409251 HYPKQ9NX55 129 aa15.24■□□□□ 0.03
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PTPRN-202ENST00000409251 SYNE4Q8N205 404 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 H3BQV1 296 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 IFFO2Q5TF58 517 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 GUCY1B3Q02153 619 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.23■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 FEZ1Q99689 392 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRN-202ENST00000409251 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
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