RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 ALDH1B1P30837 517 aa22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 CTSWP56202 376 aa22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 BCS1LQ9Y276 419 aa22.27■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 UTYO14607 1347 aa22.26■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 GNAI3P08754 354 aa22.26■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.26■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 PDE3AQ14432 1141 aa22.25■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 GPR162Q16538 588 aa22.25■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.25■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 MEIS3Q99687 375 aa22.24■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 SUCLG2Q96I99 432 aa22.24■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.23■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.23■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 COG6Q9Y2V7 657 aa22.23■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 TAF1P21675 1872 aa22.23■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.22■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 SLX4Q8IY92 1834 aa22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 FOXO4P98177 505 aa22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.21■■□□□ 1.15
SEH1L-202ENST00000399892 GRAPQ13588 217 aa22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 GREM2Q9H772 168 aa22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 CSF1RP07333 972 aa22.19■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.19■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 FAM161AQ3B820 660 aa22.19■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.19■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 GNAI2P04899 355 aa22.18■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 ITGA6P23229 1130 aa22.18■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 KAZALD1Q96I82 304 aa22.18■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.17■■□□□ 1.14
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SEH1L-202ENST00000399892 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 C21orf2O43822 256 aa22.17■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 BBOX1O75936 387 aa22.17■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.17■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.17■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 RTL9Q8NET4 1388 aa22.17■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.142e-8■■□□□ 12.9
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SEH1L-202ENST00000399892 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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SEH1L-202ENST00000399892 SOGA3Q5TF21 947 aa22.16■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 SPEF2Q9C093 1822 aa22.15■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 GRIN3BO60391 1043 aa22.15■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 TMC4Q7Z404 712 aa22.15■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.15■■□□□ 1.14
SEH1L-202ENST00000399892 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.14■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC93Q567U6 631 aa22.13■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.13■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.13■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.13■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.12■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 SP8Q8IXZ3 490 aa22.11■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 OLFM4Q6UX06 510 aa22.1■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.1■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 SRGAP3O43295 1099 aa22.1■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.1■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 COL4A1P02462 1669 aa22.09■■□□□ 1.13
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SEH1L-202ENST00000399892 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.09■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.08■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 CRBNQ96SW2 442 aa22.08■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.08■■□□□ 1.13
SEH1L-202ENST00000399892 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.07■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.07■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 MPNDQ8N594 471 aa22.06■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.06■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.06■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 MTX1Q13505 466 aa22.06■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.06■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 SLC51AQ86UW1 340 aa22.05■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 ATP8B2P98198 1209 aa22.04■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.04■■□□□ 1.12
SEH1L-202ENST00000399892 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.04■■□□□ 1.12
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