RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
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LMO2-202ENST00000395833 IL15P40933 162 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
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LMO2-202ENST00000395833 CASC1Q6TDU7 716 aa36.05■■■■□ 3.36
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LMO2-202ENST00000395833 ATG9AQ7Z3C6 839 aa36.05■■■■□ 3.36
LMO2-202ENST00000395833 ECHDC1Q9NTX5 307 aa36.05■■■■□ 3.36
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LMO2-202ENST00000395833 TNNI3KQ59H18 835 aa36.03■■■■□ 3.36
LMO2-202ENST00000395833 TBC1D9BQ66K14 1250 aa36.03■■■■□ 3.36
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LMO2-202ENST00000395833 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa36.03■■■■□ 3.36
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LMO2-202ENST00000395833 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
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LMO2-202ENST00000395833 C22orf23Q9BZE7 217 aa35.95■■■■□ 3.35
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LMO2-202ENST00000395833 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
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LMO2-202ENST00000395833 AKT1S1Q96B36 256 aa35.78■■■■□ 3.32
LMO2-202ENST00000395833 NLRP3Q96P20 1036 aa35.78■■■■□ 3.32
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