RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 SNED1Q8TER0 1413 aa25.84■■□□□ 1.73
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CLDN3-201ENST00000395145 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 BCAR3O75815 825 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 BBOX1O75936 387 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 CTSWP56202 376 aa25.83■■□□□ 1.73
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.83■■□□□ 1.73
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CLDN3-201ENST00000395145 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN3-201ENST00000395145 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.8■■□□□ 1.72
CLDN3-201ENST00000395145 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.8■■□□□ 1.72
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CLDN3-201ENST00000395145 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.77■■□□□ 1.72
CLDN3-201ENST00000395145 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.76■■□□□ 1.71
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CLDN3-201ENST00000395145 SLC51AQ86UW1 340 aa25.75■■□□□ 1.71
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CLDN3-201ENST00000395145 USP44Q9H0E7 712 aa25.74■■□□□ 1.71
CLDN3-201ENST00000395145 GREM2Q9H772 168 aa25.74■■□□□ 1.71
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CLDN3-201ENST00000395145 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.68■■□□□ 1.7
CLDN3-201ENST00000395145 MPNDQ8N594 471 aa25.68■■□□□ 1.7
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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CLDN3-201ENST00000395145 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.68■■□□□ 1.7
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CLDN3-201ENST00000395145 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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CLDN3-201ENST00000395145 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.66■■□□□ 1.7
CLDN3-201ENST00000395145 VPS33BQ9H267 617 aa25.66■■□□□ 1.7
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CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.64■■□□□ 1.7
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CLDN3-201ENST00000395145 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.62■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 MEIS3Q99687 375 aa25.62■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.62■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
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CLDN3-201ENST00000395145 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.61■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 GNAI3P08754 354 aa25.6■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 POLLQ9UGP5 575 aa25.6■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 XDHP47989 1333 aa25.6■■□□□ 1.69
CLDN3-201ENST00000395145 PPIP5K2O43314 1243 aa25.59■■□□□ 1.69
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