RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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HDDC3-202ENST00000394272 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.97■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.97■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 CIAO1O76071 339 aa24.96■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 GREM2Q9H772 168 aa24.96■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 FBXO3Q9UK99 471 aa24.96■■□□□ 1.59
HDDC3-202ENST00000394272 EYA2O00167 538 aa24.95■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 SEC24BO95487 1268 aa24.95■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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HDDC3-202ENST00000394272 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 SDSP20132 328 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 ITGA6P23229 1130 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 TFCP2Q12800 502 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 AACSQ86V21 672 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 SETDB2Q96T68 719 aa24.94■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 CASZ1Q86V15 1759 aa24.93■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.93■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC24Q50LG9 513 aa24.93■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 LRP5O75197 1615 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 TNNI3KQ59H18 835 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 AKT1S1Q96B36 256 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 NYXQ9GZU5 481 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.91■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 ERFEQ4G0M1 354 aa24.9■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 RTL9Q8NET4 1388 aa24.9■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 CDC45O75419 566 aa24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF827Q17R98 1081 aa24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 GPR108Q9NPR9 543 aa24.89■■□□□ 1.58
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.89■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.89■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 ABCC12Q96J65 1359 aa24.88■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 GYS1P13807 737 aa24.88■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 GPATCH3Q96I76 525 aa24.88■■□□□ 1.57
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HDDC3-202ENST00000394272 AK9Q5TCS8 1911 aa24.88■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 NFIXQ14938 502 aa24.87■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.87■■□□□ 1.57
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HDDC3-202ENST00000394272 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.87■■□□□ 1.57
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HDDC3-202ENST00000394272 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.87■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 ERC2O15083 957 aa24.86■■□□□ 1.57
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HDDC3-202ENST00000394272 ZNF609O15014 1411 aa24.85■■□□□ 1.57
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HDDC3-202ENST00000394272 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.85■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.84■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.83■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.83■■□□□ 1.57
HDDC3-202ENST00000394272 SPEF2Q9C093 1822 aa24.82■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 TM4SF1P30408 202 aa24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.81■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 COL4A1P02462 1669 aa24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 RILPL2Q969X0 211 aa24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 TAF1P21675 1872 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1B0GUL7 405 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 TIMM10P62072 90 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 METTL24Q5JXM2 366 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 CNTROBQ8N137 903 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 NLRP3Q96P20 1036 aa24.79■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 ATP5JP18859 108 aa24.78■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 CASC1Q6TDU7 716 aa24.78■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 CNBD1Q8NA66 436 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HDDC3-202ENST00000394272 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.77■■□□□ 1.56
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