RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 PPIP5K2O43314 1243 aa30.24■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 EIF6P56537 245 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 GPC2Q8N158 579 aa30.24■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.24■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 STK31Q9BXU1 1019 aa30.24■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 COL4A1P02462 1669 aa30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 AOC3Q16853 763 aa30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 CHADLQ6NUI6 762 aa30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 MPNDQ8N594 471 aa30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.23■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC37AA6NMS7 1700 aa30.22■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 HACL1Q9UJ83 578 aa30.22■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 KSR2Q6VAB6 950 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 G2E3Q7L622 706 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 NIM1KQ8IY84 436 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 SUPT20HQ8NEM7 779 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 VPS33BQ9H267 617 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 GJA3Q9Y6H8 435 aa30.21■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 TMC4Q7Z404 712 aa30.2■■■□□ 2.43
FAAP20-201ENST00000378543 CCER2I3L3R5 266 aa30.19■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 SLC4A2P04920 1241 aa30.19■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 EPHX2P34913 555 aa30.19■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 LDHDQ86WU2 507 aa30.18■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 DUOX1Q9NRD9 1551 aa30.18■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 CACNA1FO60840 1977 aa30.17■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 LTBP1Q14766 1721 aa30.17■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 IGKV5-2P06315 115 aa30.17■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa30.16■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 KLRG1Q96E93 195 aa30.16■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 VAMP4O75379 141 aa30.15■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA2012Q0VF49 1180 aa30.15■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 PDE8AO60658 829 aa30.14■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 SEC31BQ9NQW1 1179 aa30.14■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.14■■■□□ 2.42
FAAP20-201ENST00000378543 SCNN1DP51172 638 aa30.13■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 RPS8P62241 208 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 CLEC11AQ9Y240 323 aa30.13■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 CXCL9Q07325 125 aa30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 NEXNQ0ZGT2 675 aa30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 FLIIQ13045 1269 aa30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 GPSM2P81274 684 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.11■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 EPS15P42566 896 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 NEURL1BA8MQ27 555 aa30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 MYH3P11055 1940 aa30.09■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 PASKQ96RG2 1323 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 POLLQ9UGP5 575 aa30.08■■■□□ 2.41
FAAP20-201ENST00000378543 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 WASHC4Q2M389 1173 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 JMYQ8N9B5 988 aa30.07■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 YDJCA8MPS7 323 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 C6orf229H3BNL8 230 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 RAD17O75943 681 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 CIAPIN1Q6FI81 312 aa30.06■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 RIMBP2O15034 1052 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 DNAAF4Q8WXU2 420 aa30.05■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF521Q96K83 1311 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 H7C1W4 665 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 CTSWP56202 376 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 CREBZFQ9NS37 354 aa30.04■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 CNTROBQ8N137 903 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.03■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 GCKRQ14397 625 aa30.02■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 TNIP1Q15025 636 aa30.02■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.02■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.02■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 PODXL2Q9NZ53 605 aa30.02■■■□□ 2.4
FAAP20-201ENST00000378543 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.01■■■□□ 2.39
FAAP20-201ENST00000378543 EYA3Q99504 573 aa30.01■■■□□ 2.39
FAAP20-201ENST00000378543 SPEF2Q9C093 1822 aa30.01■■■□□ 2.39
FAAP20-201ENST00000378543 LINS1Q8NG48 757 aa30■■■□□ 2.39
FAAP20-201ENST00000378543 GREM2Q9H772 168 aa30■■■□□ 2.39
FAAP20-201ENST00000378543 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms