RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 F13A1P00488 732 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 DACT1Q9NYF0 836 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 TERF1P54274 439 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 ERO1AQ96HE7 468 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 SMC6Q96SB8 1091 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 EXOC1Q9NV70 894 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 KIF5AQ12840 1032 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 ZEB2O60315 1214 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 VAV2P52735 878 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 POTEDQ86YR6 584 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 ABCF2Q9UG63 623 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 UBA7P41226 1012 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 PHACTR2O75167 634 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 USP16Q9Y5T5 823 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 NAA25Q14CX7 972 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-204ENST00000373190 MKNK2Q9HBH9 465 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 STIM2Q9P246 746 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 A6NNZ2 444 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 IGSF3O75054 1194 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 BMP15O95972 392 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 STRN4Q9NRL3 753 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC77Q9BR77 488 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 NCOA7Q8NI08 942 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CAPZA3Q96KX2 299 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TBC1D5Q92609 795 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 MICU3Q86XE3 530 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PPP4R3AQ6IN85 833 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SYT10Q6XYQ8 523 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 MYRIPQ8NFW9 859 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 AFAP1L1Q8TED9 768 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 GRIN2BQ13224 1484 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 IL16Q14005 1332 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.01□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PPP2R3AQ06190 1150 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 FLIIQ13045 1269 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TSHZ3Q63HK5 1081 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC50Q8IVM0 306 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 TSNARE1Q96NA8 513 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PIK3R4Q99570 1358 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ZBTB16Q05516 673 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PLCD3Q8N3E9 789 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SELENOSQ9BQE4 189 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SARNPP82979 210 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 RRAGBQ5VZM2 374 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SLC26A6Q9BXS9 759 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SERPINA10Q9UK55 444 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 ATP11AP98196 1134 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 PSMA7O14818 248 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 RHOXF2BP0C7M4 288 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 RHOXF2Q9BQY4 288 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRT-204ENST00000373190 F6X3S4 739 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 LMBR1Q8WVP7 490 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 IQGAP2Q13576 1575 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-204ENST00000373190 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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