RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 CA12O43570 354 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 AOC2O75106 756 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNIP1Q15025 636 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 HHIPL1Q96JK4 782 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSKSQ9UJT2 592 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAD17O75943 681 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANXA1P04083 346 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 PROSER3Q2NL68 480 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLRP10Q86W26 655 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRAPQ13588 217 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 COPS6Q7L5N1 327 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 H7C1D1 291 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIPK4P57078 832 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGS19P49795 217 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 TCIRG1Q13488 830 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMC4Q7Z404 712 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-204ENST00000373166 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC34A2O95436 690 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 NECTIN2Q92692 538 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 RUNDC1Q96C34 613 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 YDJCA8MPS7 323 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOGQ13253 232 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP48Q86UV5 1035 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 MICALL2Q8IY33 904 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANP32CO43423 234 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 WASHC4Q2M389 1173 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 DPF2Q92785 391 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 CFAP44Q96MT7 982 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 HUNKP57058 714 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3-204ENST00000373166 SHTN1A0MZ66 631 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEUROD2Q15784 382 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMD14O00487 310 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 DGKZQ13574 1117 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 DBNDD1Q9H9R9 158 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 C6orf229H3BNL8 230 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF428Q96B54 188 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZIC5Q96T25 663 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIMBP2O15034 1052 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGMBQ6NW40 437 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM89AQ96GI7 184 aa24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUOX1Q9NRD9 1551 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHL1O00533 1208 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT24Q2M2I5 525 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 DLK2Q6UY11 383 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC102AQ96A19 550 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 EYA3Q99504 573 aa24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLLQ9UGP5 575 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAMB2P55268 1798 aa24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 ECE2O60344 883 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 EGFRP00533 1210 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPSM2P81274 684 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 DOK7Q18PE1 504 aa24.86■■□□□ 1.57
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