RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367995.3

ADAMTS4-201, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADAMTS4, Length 1,961 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.34■□□□□ 0.85
ADAMTS4-201ENST00000367995 PTMSP20962 102 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 GPTP24298 496 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 ATP6V1AP38606 617 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 LRRC24Q50LG9 513 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 FAM227BQ96M60 508 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 PTH1RQ03431 593 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TICAM2Q86XR7 235 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 MED23Q9ULK4 1368 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 SIK1P57059 783 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CUL4AQ13619 759 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 VPS72Q15906 364 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 KCNB2Q92953 911 aa20.32■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 PALLDQ8WX93 1383 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 MYH3P11055 1940 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 A0A0D9SFI3 127 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.31■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 RASEFQ8IZ41 740 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 MAP4K1Q92918 833 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 NGLY1Q96IV0 654 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 SSFA2P28290 1259 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 KCNJ4P48050 445 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 C8orf37Q96NL8 207 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 SPEF2Q9C093 1822 aa20.3■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 A0A1B0GUL7 405 aa20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CTSWP56202 376 aa20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 NECTIN1Q15223 517 aa20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.29■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TIMM10P62072 90 aa20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 RNF20Q5VTR2 975 aa20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 TTC14Q96N46 770 aa20.28■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 PDE8AO60658 829 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 AK7Q96M32 723 aa20.27■□□□□ 0.84
ADAMTS4-201ENST00000367995 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 TRAK2O60296 914 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 ITGA6P23229 1130 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 ITPK1Q13572 414 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 SYNE4Q8N205 404 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 PSMA5P28066 241 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 GREM2Q9H772 168 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.25■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 SLC27A2O14975 620 aa20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 PARP10Q53GL7 1025 aa20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 GORABQ5T7V8 394 aa20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 VPS53Q5VIR6 699 aa20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.24■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.23■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 GOLIM4O00461 696 aa20.23■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 TAF5LO75529 589 aa20.23■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 AK2P54819 239 aa20.23■□□□□ 0.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms