RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.99■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 RAB11FIP3O75154 756 aa21.99■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.99■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.99■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 GREM2Q9H772 168 aa21.99■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 NPHP1O15259 732 aa21.99■■□□□ 1.11
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LTV1-201ENST00000367576 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.112e-7■□□□□ 10.7
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LTV1-201ENST00000367576 NYXQ9GZU5 481 aa21.98■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 COPRSQ9NQ92 184 aa21.98■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 MYH3P11055 1940 aa21.98■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.97■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 MSL1Q68DK7 614 aa21.96■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.96■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.96■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 ITGA6P23229 1130 aa21.96■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.96■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 SASH1O94885 1247 aa21.95■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 DDR1Q08345 913 aa21.95■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.95■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.94■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 CNBD1Q8NA66 436 aa21.94■■□□□ 1.1
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LTV1-201ENST00000367576 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.94■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 LRRC24Q50LG9 513 aa21.94■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 CCDC125Q86Z20 511 aa21.94■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 TM4SF1P30408 202 aa21.93■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.93■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.93■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 SERPINB2P05120 415 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 CASZ1Q86V15 1759 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 TFCP2Q12800 502 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.92■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 EYA2O00167 538 aa21.91■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 COL4A1P02462 1669 aa21.9■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.9■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.9■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 AACSQ86V21 672 aa21.9■■□□□ 1.1
LTV1-201ENST00000367576 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
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LTV1-201ENST00000367576 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.89■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 LRP5O75197 1615 aa21.89■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 MMP10P09238 476 aa21.88■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 MX1P20591 662 aa21.88■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
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LTV1-201ENST00000367576 ST5P78524 1137 aa21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 PDE1AP54750 535 aa21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.87■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 RTL9Q8NET4 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 TNNI3KQ59H18 835 aa21.85■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 TTC22Q5TAA0 569 aa21.85■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.85■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.85■■□□□ 1.09
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LTV1-201ENST00000367576 METTL24Q5JXM2 366 aa21.84■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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LTV1-201ENST00000367576 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.83■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.83■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 TAF1P21675 1872 aa21.83■■□□□ 1.09
LTV1-201ENST00000367576 ZNF609O15014 1411 aa21.83■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 FBXO3Q9UK99 471 aa21.83■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.81■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.81■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.81■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.81■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 STAP2Q9UGK3 403 aa21.81■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 C8orf34Q49A92 452 aa21.8■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.8■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.8■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LTV1-201ENST00000367576 TIMM10P62072 90 aa21.79■■□□□ 1.08
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