RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 GABBR2O75899 941 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SOX9P48436 509 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NFE2L2Q16236 605 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 EML3Q32P44 896 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MORN1Q5T089 497 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 LILRB2Q8N423 598 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PCGF6Q9BYE7 350 aa3.42□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC5O00471 708 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FOXO3O43524 673 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SORBS3O60504 671 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RALBP1Q15311 655 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf96Q7Z7L8 435 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FAM13AO94988 1023 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MAP9Q49MG5 647 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA1Q8ND90 353 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CRELD1Q96HD1 420 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MST1RQ04912 1400 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM50Q86XT4 487 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SIRPGQ9P1W8 387 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NRKQ7Z2Y5 1582 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GNA15P30679 374 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GNALP38405 381 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GPR153Q6NV75 609 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PCGF5Q86SE9 256 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FBF1Q8TES7 1133 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO41Q8TF61 875 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 IL17RAQ96F46 866 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC113Q9H0I3 377 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SPC25Q9HBM1 224 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NPATQ14207 1427 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRB2O60241 1585 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PEX14O75381 377 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GARTP22102 1010 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MASP1P48740 699 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GORABQ5T7V8 394 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SCYL1Q96KG9 808 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SAP130Q9H0E3 1048 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC87Q9NVE4 849 aa3.4□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC6O75061 913 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 COL6A1P12109 1028 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ATP1A2P50993 1020 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 VPS72Q15906 364 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SVIPQ8NHG7 77 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CASS4Q9NQ75 786 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP12Q02952 1782 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PAPPAQ13219 1627 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FAM221BA6H8Z2 402 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PLCB3Q01970 1234 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SQSTM1Q13501 440 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 ARSHQ5FYA8 562 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 FMNL3Q8IVF7 1028 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SEC16BQ96JE7 1060 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 SNTG2Q9NY99 539 aa3.4□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MYO19Q96H55 970 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 HRH3Q9Y5N1 445 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP69A5D8W1 941 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 BDNFP23560 247 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 RAB33AQ14088 237 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.876e-8■■■■■ 28.2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC4A9Q96Q91 983 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 CPS1P31327 1500 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 TRPM2O94759 1503 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PLCG2P16885 1265 aa3.39□□□□□ -1.87
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRNQ16849 979 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms