RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC77Q9BR77 488 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 KDM5CP41229 1560 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MAPKBP1O60336 1514 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ABCA8O94911 1581 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ABCD1P33897 745 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 SLFN5Q08AF3 891 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 P3H4Q92791 437 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 VWA3BQ502W6 1294 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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PTPRD-201ENST00000355233 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MX1P20591 662 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF445P59923 1031 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 CNGA4Q8IV77 575 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRD-201ENST00000355233 MPHOSPH8Q99549 860 aa5.61□□□□□ -1.51
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