RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 MPNDQ8N594 471 aa25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP7D2Q96T17 732 aa25.51■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.5■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 TFCP2Q12800 502 aa25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K11Q16584 847 aa25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 NEK1Q96PY6 1258 aa25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 USP16Q9Y5T5 823 aa25.49■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 TPM3P06753 285 aa25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 STK3Q13188 491 aa25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA32Q96LK8 384 aa25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.47■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 COL15A1P39059 1388 aa25.47■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAF5Q96JK2 942 aa25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 MST1RQ04912 1400 aa25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 LIG1P18858 919 aa25.46■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PTDSS1-201ENST00000337004 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 GTF3C6Q969F1 213 aa25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A087WZG4 1122 aa25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 HAUS7Q99871 368 aa25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 TNMDQ9H2S6 317 aa25.45■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 CAMK4Q16566 473 aa25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.44■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 AP5Z1O43299 807 aa25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 TYRO3Q06418 890 aa25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 DACT1Q9NYF0 836 aa25.43■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 Q6ZUG5 572 aa25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.41■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP21A2P08686 494 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 C5P01031 1676 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF609O15014 1411 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 H3BQV1 296 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 JAK2O60674 1132 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 IFFO2Q5TF58 517 aa25.4■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 FGD1P98174 961 aa25.39■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.39■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 MEGF6O75095 1541 aa25.39■■□□□ 1.66
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CABP4P57796 275 aa25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 BRF1Q92994 677 aa25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.39■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CYP27B1O15528 508 aa25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CASP7P55210 303 aa25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP45Q9UL16 551 aa25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 BICD2Q8TD16 824 aa25.38■■□□□ 1.65
PTDSS1-201ENST00000337004 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
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