RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 NPHP1O15259 732 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 TM4SF1P30408 202 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 ERFEQ4G0M1 354 aa24.18■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 RGS3P49796 1198 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.17■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 C4AP0C0L4 1744 aa24.15■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.14■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.14■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 SKAP1Q86WV1 359 aa24.14■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.14■■□□□ 1.46
VSTM2B-201ENST00000335523 SERPINB2P05120 415 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM161AQ3B820 660 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 CNBD1Q8NA66 436 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 NLRP3Q96P20 1036 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 FBXO3Q9UK99 471 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 SIL1Q9H173 461 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 GREM2Q9H772 168 aa24.13■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 ITGA6P23229 1130 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE4AP27815 886 aa24.12■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.11■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 EYA2O00167 538 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 CIAO1O76071 339 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 ST5P78524 1137 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 BCL11AQ9H165 835 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 CASZ1Q86V15 1759 aa24.1■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 RTL9Q8NET4 1388 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 DDR1Q08345 913 aa24.09■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.08■■□□□ 1.45
VSTM2B-201ENST00000335523 SASH1O94885 1247 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 ABCC12Q96J65 1359 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 MMP10P09238 476 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 SPON1Q9HCB6 807 aa24.06■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.05■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC24Q50LG9 513 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 MSL1Q68DK7 614 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.04■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 TFCP2Q12800 502 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.03■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.02■■□□□ 1.44
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 MTFR1LQ9H019 292 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 GPR108Q9NPR9 543 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.01■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 AACSQ86V21 672 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 BRIP1Q9BX63 1249 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 MX1P20591 662 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE1AP54750 535 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 GPATCH3Q96I76 525 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 STAP2Q9UGK3 403 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH3P11055 1940 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 TNNI3KQ59H18 835 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 METTL24Q5JXM2 366 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.99■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 LAMB2P55268 1798 aa23.98■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 PDE6BP35913 854 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 CRY2Q49AN0 593 aa23.97■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
VSTM2B-201ENST00000335523 AOX1Q06278 1338 aa23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms