RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDCA7LQ96GN5 454 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL4A5P29400 1685 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR90Q96KV7 1748 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYH3P11055 1940 aa25■■□□□ 1.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 BBOX1O75936 387 aa24.99■■□□□ 1.59
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PTPRCAP-201ENST00000326294 LINS1Q8NG48 757 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.93■■□□□ 1.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.92■■□□□ 1.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 BEND3Q5T5X7 828 aa24.91■■□□□ 1.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SPEF2Q9C093 1822 aa24.9■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 POTECB2RU33 542 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.89■■□□□ 1.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIP5K2O43314 1243 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SUPT20HQ8NEM7 779 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 JDP2Q8WYK2 163 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G12BQ9BX93 195 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTL9Q8NET4 1388 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCN4AP35499 1836 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL2L13Q9BXK5 485 aa24.86■■□□□ 1.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GPSM2P81274 684 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 GREM2Q9H772 168 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.84■■□□□ 1.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRCP08575 1304 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.83■■□□□ 1.57
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH1L1O75891 902 aa24.82■■□□□ 1.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 GPC2Q8N158 579 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM161AQ3B820 660 aa24.81■■□□□ 1.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLLQ9UGP5 575 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRM8O00222 908 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF1RP07333 972 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA6P17066 643 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.79■■□□□ 1.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXO4P98177 505 aa24.78■■□□□ 1.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.78■■□□□ 1.56
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PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf229H3BNL8 230 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGA6P23229 1130 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASHC4Q2M389 1173 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 HACL1Q9UJ83 578 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 XDHP47989 1333 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GUL6 1792 aa24.75■■□□□ 1.55
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