RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A0G2JLW4 131 aa19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM89AQ96GI7 184 aa19.53■□□□□ 0.72
TSNARE1-201ENST00000307180 CHRNA5P30532 468 aa19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1-201ENST00000307180 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
TSNARE1-201ENST00000307180 NEURL1BA8MQ27 555 aa19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCC12Q96J65 1359 aa19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 BEND3Q5T5X7 828 aa19.51■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 DPEP1P16444 411 aa19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 LINS1Q8NG48 757 aa19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF13BQ9NQT8 1826 aa19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 HMMRO75330 724 aa19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM25P49756 843 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 TGFB2P61812 414 aa19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 GNAI2P04899 355 aa19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE6BP35913 854 aa19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 C2CD5Q86YS7 1000 aa19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.48■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 GCKRQ14397 625 aa19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 H0YIN7 160 aa19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 GNAI3P08754 354 aa19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.47■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNA3P22001 575 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC22Q5TAA0 569 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC45O75419 566 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 NLRP3Q96P20 1036 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 ANTXR1Q9H6X2 564 aa19.45■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 APBB1O00213 710 aa19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC10A5Q5PT55 438 aa19.44■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 ALDH1L1O75891 902 aa19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 H7C1W4 665 aa19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 SRGNP10124 158 aa19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP8B2P98198 1209 aa19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 PIM2Q9P1W9 311 aa19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 BCS1LQ9Y276 419 aa19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 GRM8O00222 908 aa19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 MASTLQ96GX5 879 aa19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 USP44Q9H0E7 712 aa19.41■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 CASP7P55210 303 aa19.4■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR162Q16538 588 aa19.4■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 CDHR2Q9BYE9 1310 aa19.39■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE8AO60658 829 aa19.39■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 NPR1P16066 1061 aa19.39■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 CRY2Q49AN0 593 aa19.39■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.7
TSNARE1-201ENST00000307180 LAMB2P55268 1798 aa19.39■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 RIC1Q4ADV7 1423 aa19.39■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 UTRNP46939 3433 aa19.39■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 HSCBQ8IWL3 235 aa19.39■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX21Q969T3 373 aa19.39■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 TTLL6Q8N841 843 aa19.38■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 STYK1Q6J9G0 422 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 KIF2CQ99661 725 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNA1SQ13698 1873 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 SDSP20132 328 aa19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TSNARE1-201ENST00000307180 CTSWP56202 376 aa19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms