RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000304552.4

CXCR6-201, Transcript of C-X-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCR6, Length 1,962 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6-201ENST00000304552 LARGE1O95461 756 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 TAF6LQ9Y6J9 622 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 ATP5JP18859 108 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 CHGBP05060 677 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 CASTP20810 708 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 ST3GAL1Q11201 340 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 KIF6Q6ZMV9 814 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 TJP1Q07157 1748 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 DISP2A7MBM2 1401 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 HIP1O00291 1037 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 TCIRG1Q13488 830 aa10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CXCR6-201ENST00000304552 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SLC27A2O14975 620 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TOM1O60784 492 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ZNF445P59923 1031 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 DDB1Q16531 1140 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 VPS53Q5VIR6 699 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 FAM89AQ96GI7 184 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 FSD1Q9BTV5 496 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.33□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TAF5LO75529 589 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 GPTP24298 496 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 HLFQ16534 295 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 BCL9O00512 1426 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ZNF609O15014 1411 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 HAUS7Q99871 368 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.32□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 DTNBO60941 627 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 LRRC24Q50LG9 513 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SYNE4Q8N205 404 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 PDRG1Q9NUG6 133 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.31□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TIMM10P62072 90 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ME3Q16798 604 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 GPR108Q9NPR9 543 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 RFX7Q2KHR2 1363 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SYT1P21579 422 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 TPCN1Q9ULQ1 816 aa10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 EYA2O00167 538 aa10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 SLFNL1Q499Z3 407 aa10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CXCR6-201ENST00000304552 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms