RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 SIL1Q9H173 461 aa25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 STK32BQ9NY57 414 aa25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL11AQ9H165 835 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 MSH5O43196 834 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC15A2Q16348 729 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 ERFEQ4G0M1 354 aa25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 GREM2Q9H772 168 aa25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3-201ENST00000298838 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.58■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 CASZ1Q86V15 1759 aa25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 NPHP1O15259 732 aa25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC12Q96J65 1359 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGA6P23229 1130 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.56■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 TM4SF1P30408 202 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 CNBD1Q8NA66 436 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO3Q9UK99 471 aa25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 RTL9Q8NET4 1388 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 SASH1O94885 1247 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 EYA2O00167 538 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 CIAO1O76071 339 aa25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 LRP5O75197 1615 aa25.52■■□□□ 1.68
PACSIN3-201ENST00000298838 SERPINB2P05120 415 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP3Q96P20 1036 aa25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 MX1P20591 662 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 DDR1Q08345 913 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC24Q50LG9 513 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE1AP54750 535 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 ST5P78524 1137 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 TFCP2Q12800 502 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 AACSQ86V21 672 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.48■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 SPEF2Q9C093 1822 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 STAP2Q9UGK3 403 aa25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3-201ENST00000298838 TNNI3KQ59H18 835 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC22Q5TAA0 569 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 AOX1Q06278 1338 aa25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 MMP10P09238 476 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 MSL1Q68DK7 614 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.663e-18■■■■■ 86.9
PACSIN3-201ENST00000298838 GPATCH3Q96I76 525 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR108Q9NPR9 543 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF609O15014 1411 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL24Q5JXM2 366 aa25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF1P21675 1872 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 COL4A1P02462 1669 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 C8orf34Q49A92 452 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.4■■□□□ 1.66
PACSIN3-201ENST00000298838 ERC2O15083 957 aa25.39■■□□□ 1.65
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