RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.66■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 USP21Q9UK80 565 aa31.66■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF609O15014 1411 aa31.66■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 FSD1Q9BTV5 496 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 FBXO3Q9UK99 471 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 NEK4P51957 841 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 FOXD4L1Q9NU39 408 aa31.65■■■□□ 2.66
FOXQ1-201ENST00000296839 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.64■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 CERKQ8TCT0 537 aa31.63■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM227BQ96M60 508 aa31.62■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 HAUS7Q99871 368 aa31.61■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 SNRKQ9NRH2 765 aa31.61■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 NEUROD6Q96NK8 337 aa31.61■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 TTLL11Q8NHH1 800 aa31.6■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 CTSWP56202 376 aa31.6■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 TIMM10P62072 90 aa31.6■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 PTH1RQ03431 593 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 RFX7Q2KHR2 1363 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 MCM2P49736 904 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 TAF7LQ5H9L4 462 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 SNX14Q9Y5W7 946 aa31.59■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 CAMTA2O94983 1202 aa31.58■■■□□ 2.65
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC171Q6TFL3 1326 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A0D9SFI3 127 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1B0GUL7 405 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 PDE8AO60658 829 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 IL27Q8NEV9 243 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 GREM2Q9H772 168 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 BCORQ6W2J9 1755 aa31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 MED23Q9ULK4 1368 aa31.56■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa31.56■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 ITGA6P23229 1130 aa31.55■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 BTAF1O14981 1849 aa31.55■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 NHSQ6T4R5 1651 aa31.55■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 RAB3GAP1Q15042 981 aa31.55■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 RASEFQ8IZ41 740 aa31.55■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 SUSD4Q5VX71 490 aa31.54■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 AKAP2Q9Y2D5 859 aa31.54■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 LINC00116Q8NCU8 138 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 KCNB2Q92953 911 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 AK7Q96M32 723 aa31.53■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 SPEF2Q9C093 1822 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 MCM4P33991 863 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 MAP4K1Q92918 833 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 TMX3Q96JJ7 454 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXQ1-201ENST00000296839 PARP10Q53GL7 1025 aa31.51■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 PTF1AQ7RTS3 328 aa31.51■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 SH3TC1Q8TE82 1336 aa31.51■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 NECTIN1Q15223 517 aa31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 HSPA1LP34931 641 aa31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 KBTBD3Q8NAB2 608 aa31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 LAMB2P55268 1798 aa31.5■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 LRP5O75197 1615 aa31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 DEKP35659 375 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 PAG1Q9NWQ8 432 aa31.49■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa31.48■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 XAGE2Q96GT9 111 aa31.47■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 ADORA1P30542 326 aa31.47■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 METTL24Q5JXM2 366 aa31.47■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 GOLIM4O00461 696 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 CUL4AQ13619 759 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 TICAM2Q86XR7 235 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 TTC14Q96N46 770 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 AFF2P51816 1311 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 CNNM1Q9NRU3 951 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.46■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 CREB3L3Q68CJ9 461 aa31.45■■■□□ 2.63
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM177BA6PVY3 158 aa31.44■■■□□ 2.62
FOXQ1-201ENST00000296839 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
FOXQ1-201ENST00000296839 KCNJ4P48050 445 aa31.44■■■□□ 2.62
FOXQ1-201ENST00000296839 KCNQ4P56696 695 aa31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms