RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.87■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 CCDC172P0C7W6 258 aa25.87■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.87■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 PTGS1P23219 599 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 PLCB2Q00722 1185 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 GYS2P54840 703 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 TRIM66O15016 1216 aa25.85■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 MEGF6O75095 1541 aa25.85■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 CEP135Q66GS9 1140 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 USP48Q86UV5 1035 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 NEK11Q8NG66 645 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 JRKLQ9Y4A0 524 aa25.83■■□□□ 1.73
PITX1-201ENST00000265340 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.83■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 ANXA1P04083 346 aa25.83■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 TPM4P67936 248 aa25.83■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 ELF2Q15723 593 aa25.83■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 CEP120Q8N960 986 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 HOXB7P09629 217 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.81■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.81■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 A0A1B0GUL7 405 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 SRLQ86TD4 932 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 GTF3C6Q969F1 213 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.8■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 SLIT2O94813 1529 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 APBB1O00213 710 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G4AP47712 749 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN26Q16670 478 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 GNAI2P04899 355 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 GPS2Q13227 327 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 CUL4AQ13619 759 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 PHKG2P15735 406 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 MCM2P49736 904 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 TMX3Q96JJ7 454 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 USP44Q9H0E7 712 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 DONSONQ9NYP3 566 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.76■■□□□ 1.72
PITX1-201ENST00000265340 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 IL2RBP14784 551 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 NRAPQ86VF7 1730 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 ATP2B1P20020 1258 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 LRMPQ12912 555 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 PROSER3Q2NL68 480 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SLC39A6Q13433 755 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 GNAI3P08754 354 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 GPATCH11Q8N954 259 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 TOMM22Q9NS69 142 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 USP21Q9UK80 565 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 CYP27B1O15528 508 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SATB1Q01826 763 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 GRIPAP1Q4V328 841 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 ZNF592Q92610 1267 aa25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms