RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 ERFEQ4G0M1 354 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 NFIXQ14938 502 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 NYXQ9GZU5 481 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 GREM2Q9H772 168 aa21.99■■□□□ 1.11
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IMP4-201ENST00000259239 MSH5O43196 834 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 SASH1O94885 1247 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-201ENST00000259239 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 STK32BQ9NY57 414 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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IMP4-201ENST00000259239 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.94■■□□□ 1.1
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IMP4-201ENST00000259239 TM4SF1P30408 202 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 LRRC24Q50LG9 513 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.93■■□□□ 1.1
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IMP4-201ENST00000259239 CNBD1Q8NA66 436 aa21.92■■□□□ 1.1
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IMP4-201ENST00000259239 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 PDE1AP54750 535 aa21.91■■□□□ 1.1
IMP4-201ENST00000259239 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.91■■□□□ 1.1
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IMP4-201ENST00000259239 C8orf34Q49A92 452 aa21.89■■□□□ 1.09
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IMP4-201ENST00000259239 TTC22Q5TAA0 569 aa21.89■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.89■■□□□ 1.09
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IMP4-201ENST00000259239 A0A1B0GUL6 1792 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 MSL1Q68DK7 614 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 NLRP3Q96P20 1036 aa21.88■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 STAP2Q9UGK3 403 aa21.87■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 TNNI3KQ59H18 835 aa21.86■■□□□ 1.09
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IMP4-201ENST00000259239 ST5P78524 1137 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 BACH2Q9BYV9 841 aa21.86■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.86■■□□□ 1.09
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IMP4-201ENST00000259239 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.84■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 MMP10P09238 476 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.83■■□□□ 1.09
IMP4-201ENST00000259239 METTL24Q5JXM2 366 aa21.83■■□□□ 1.08
IMP4-201ENST00000259239 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.83■■□□□ 1.08
IMP4-201ENST00000259239 GPR108Q9NPR9 543 aa21.83■■□□□ 1.08
IMP4-201ENST00000259239 TTC41PQ6P2S7 1318 aa21.82■■□□□ 1.08
IMP4-201ENST00000259239 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.82■■□□□ 1.08
IMP4-201ENST00000259239 GPATCH3Q96I76 525 aa21.82■■□□□ 1.08
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