RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 CASP7P55210 303 aa26.7■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 CEP350Q5VT06 3117 aa26.7■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 SBF1O95248 1867 aa26.7■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 ABCC4O15439 1325 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 KIF16BQ96L93 1317 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 ALDH1B1P30837 517 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 PRELPP51888 382 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 SLC51AQ86UW1 340 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.69■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 NFKBIEO00221 500 aa26.68■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 PDE8AO60658 829 aa26.68■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 ALDH1L1O75891 902 aa26.68■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 OLFM4Q6UX06 510 aa26.67■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.66■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 GLTPD2A6NH11 291 aa26.66■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 SNED1Q8TER0 1413 aa26.65■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 GRM8O00222 908 aa26.64■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 FSTL1Q12841 308 aa26.64■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 TNNQ9UQP3 1299 aa26.64■■□□□ 1.86
COX5B-201ENST00000258424 SPEF2Q9C093 1822 aa26.63■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.63■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 CTSWP56202 376 aa26.63■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 GRAPQ13588 217 aa26.62■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.62■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.62■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 TRIM27P14373 513 aa26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 SOGA3Q5TF21 947 aa26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.6■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 CCDC93Q567U6 631 aa26.6■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.59■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 UTYO14607 1347 aa26.59■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.59■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.58■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.58■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
COX5B-201ENST00000258424 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 BBOX1O75936 387 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 FOXO4P98177 505 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 GREM2Q9H772 168 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 RTL9Q8NET4 1388 aa26.57■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.56■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 SUCLG2Q96I99 432 aa26.56■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 USP44Q9H0E7 712 aa26.56■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 CSF1RP07333 972 aa26.55■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 FAM161AQ3B820 660 aa26.55■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.55■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 KAZALD1Q96I82 304 aa26.55■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 LTBP1Q14766 1721 aa26.54■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.54■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.54■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 SP8Q8IXZ3 490 aa26.53■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.53■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.53■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
COX5B-201ENST00000258424 POTECB2RU33 542 aa26.51■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.51■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 TMC4Q7Z404 712 aa26.51■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 ITGA6P23229 1130 aa26.5■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 HTRA3P83110 453 aa26.5■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 PSMD1Q99460 953 aa26.5■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.49■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.49■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.49■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 COL4A5P29400 1685 aa26.48■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 RLBP1P12271 317 aa26.48■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 MEIS3Q99687 375 aa26.48■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.48■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 A0A1B0GUL6 1792 aa26.48■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.47■■□□□ 1.83
COX5B-201ENST00000258424 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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